Первое упоминание о деревне Эйвере относится к 1414 году, а упоминание об одноименной мызе — к 1552 году. В 1836 году мыза перешла в собственность семейства Стакельберг. Последним владельцем мызы являлся Эрнст фон Стакельберг, в собственности которого она находилась до 1919 года. Затем в результате земельной реформы после обретения Эстонией независимости она перешла в собственность эстонского правительства. После окончания Второй мировой войны (1945) и вплоть до 2000 года в здании работал детский дом и дом престарелых.